Mycenae Arvernenses:  Les Mycènes d'Auvergne et d'ailleurs

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Un diaporama de présentation des Mycènes d'Auvergne (70MO)

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è     Méthodes d'étude

Voir plus bas pour une phylogénie des Mycena sl

Liste des espèces par sections:

 

Aciculae

acicula

Fragilipedes

abramsii

Hygrocyboideae

epipterygia var viscosa

Rubromarginatae

albidolilacea

Adonideae

adonis

 

aetites

Intermediae

fontqueri

 

aurantiistipitata

 

flavoalba

 

algeriensis

 

latifolia

 

capillaripes

 

floridula

 

citrinomarginata

Lactipides

erubescens

 

olivaceomarginata

 

leptophylla

 

laevigatoides

galopus

 

purpureofusca

Adornatae

fuscoumbilicata

 

leptocephala

Longisetae

aciculata

renati

Amictae

amicta

 

niveipes

Luculentae

 

aurantiomarginata

 

roseoquercina

Basipedes

mucor

 

olida

rosella

 

rubromarginata

 

stylobates

 

plumipes

rosella var albida

 

seynii

Bulbosae

bulbosa

 

polygramma

Mycena

atrochalybaea

Sacchariferae

adscendens

Calamophilae

belliarum

 

scirpicola

 

fagetorum

 

corynephora

Calodontes

pelianthina

 

silvae-nigrae

 

flos-nivium

 

nucicola

 

pearsoniana

 

stipata

 

galericulata

Sanguinolentae

sanguinolenta

 

pura

 

stipata f. alba

 

hemisphaerica

Supinae

juniperina

 

rosea

 

villicaulis

 

inclinata

 

meliigena

Cinerellae

clavicularis

 

vitilis

 

maculata

 

pseudocorticola

cinerella

 

zephirus

megaspora

 

supina

 

concolor

Exornatae

margarita

 

romagnesiana

 

venustula

 

pseudopicta

Fuliginellae

vulgaris

 

tintinnabulum

Viscipelles

cyanorhiza

winterhoffii

Galactopoda

haematopus

Polyadelphia

capillaris

 

flagellata

Clavulares

clavularis

Hiemales

alba

 

polyadelpha

pachyderma

Crocatae

crocata

 

atropapillata

 

querciphila

Mycopan

scabripes

Filipedes

arcangeliana

 

clavata

 

quercus-ilicis

Roridomyces

roridus

 

filopes

 

hiemalis

 

smithiana

 

 

 

flavescens

 

radicifer

Pterigenae

pterigena

 

 

 

metata

speirea

 

 

 

 

 

mirata

 

 

 

 

septentrionalis

 

 

 

 

 

 

 

xantholeuca

 

 

 

 

 

 

 

Liste alphabétique des espèces:

 

abramsii

citrinomarginata

haematopus

pearsoniana

rubromarginata

acicula

clavata

hemisphaerica

pelianthina

sanguinolenta

aciculata

clavicularis

hiemalis

plumipes

scirpicola

adonis

clavularis

inclinata

polyadelpha

septentrionalis

adscendens

concolor

juniperina

polygramma

seynii

aetites

corynephora

laevigatoides

pseudocorticola

silvae-nigrae

alba

crocata

latifolia

pseudopicta

smithiana

albidolilacea

cyanorhiza

leptocephala

pterigena

speirea

algeriensis

epipterygia var viscosa

leptophylla

pura

stipata

amicta

erubescens

maculata

purpureofusca

stipata f alba

arcangeliana

fagetorum

margarita

querciphila

stylobates

atrochalybaea

filopes

megaspora

quercus-ilicis

supina

atropapillata

flagellata

meliigena

radicifer

tintinnabulum

aurantiistipitata

flavescens

metata

renati

venustula

aurantiomarginata

flavoalba

mirata

romagnesiana

villicaulis

belliarum

flos-nivium

mucor

R. roridus

vitilis

bulbosa

floridula

niveipes

rosea

vulgaris

capillaripes

fontqueri

nucicola

rosella

xantholeuca

capillaris

fuscoumbilicata

olida

rosella var albida

winterhoffii

cinerella

galericulata

olivaceomarginata

roseoquercina

zephirus

 

galopus

pachyderma

 

 

 

Je suis preneur de photos et d'exsiccata d'espèces non représentées ici (contact).

I take photos and exsiccata of species not represented here (contact).

 

Phylogénie des Mycena sl.

 

Méthode: pour construire cet arbre j’ai extrait l’ensemble des séquences ITS disponibles dans les bases GenBank, Unite et Bold pour les genres Mycena et alliés (soit >2000 séquences). Pour chaque espèces j’ai retenu deux séquences typiques « REF », c’est-à-dire celles appartenant au clade où la majorité des séquences de l’espèce sont présentes. Toutes les séquences disponibles pour les TYPES sont prises en compte également. Les séquences sont alignées selon l’algorithme ClustalW puis l’arbre est construit avec l’hypothèse du « Maximum Likelihood » avec Mega11.

 

Method: To build this tree I extracted all the ITS sequences available in the GenBank, Unite and Bold databases for the genera Mycena and allies (>2000 sequences). For each species I selected two typical "REF" sequences, i.e. those belonging to the clade where the majority of the sequences of the species are present. All sequences available for the TYPES are also taken into account. The sequences are aligned according to the ClustalW algorithm and then the tree is constructed with the "Maximum Likelihood" hypothesis with Mega11.

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